Deze in juni 1990 uitgebrachte machine bevatte tal van verbeteringen. Voor het eerst werd er een volledig 32-bit processor, de 68030, gebruikt en deze was eenvoudig te upgraden middels een speciaal processorbord. Standaard werd deze geleverd op 16 of 25 MHz.

Uitbreidingen konden gedaan worden met de nieuwe en veel snellere 32-bit Zorro III-bus.

Een variant is de A3000UX waar Commodore een overeenkomst had met AT&T om Unix System V (release 4) mee te leveren. Er is ook een variant in een toren, de A3000T.

Het mainboard bevat een DMA SCSI-controller en een VGA-aansluiting naast de standaard RGB-aansluiting. Hiermee de enige Amiga met deze 2 extra's aan boord.

Er is nog een prototype opvolger geweest, de A3000+. Deze zou de nieuwe chipset bevatten. Echter was deze nog niet gereed voor productie en werd het project geschrapt, om vervangen te worden met de Amiga 4000 in 1992.

Velen zijn van mening dat dit de beste Amiga is. De opvolger werd goedkoper geproduceerd waardoor er op kwaliteit is ingeleverd. Er zijn er ook niet veel verkocht daar de Amiga 2000 nog vaak voldeed en de aankondiging van een nieuwe chipset mensen deed wachten.